O Imelga tamén ten unha función importante na xestión de transplantes de órganos. Aínda que esta actividade pode ter un compoñente xudicial nos casos de falecemento por causas violentas, accidentais ou por suicidio. Esta colaboración é esencial para garantir que os procedementos de transplante se realizan conforme a legalidade e os protocolos éticos establecidos.